La Jougnena prend sa source en Suisse et s'écoule en traversant la commune de Jougne avant de franchir à nouveau la frontière pour se jeter dans l'Orbe.

Classé en première catégorie piscicole, le parcours de l'AAPPMA comprend la quasi-totalité de la partie française de la rivière, soit 9,4 km. Les « grand » et « petit » étangs complètent le parcours et sont accessibles aux personnes à mobilité réduite.